Egyedülállóan lebilincselő művészi stílusával és az általuk lakott vécéknél mélyebb karakterekkel, a WC-hez kötött Hanako-kun egy végtelenül lenyűgöző és egyedülállóan komikus történet a barátságról és a sötét történelmek legyőzéséről.
– Hanako-san, Hanako-san... ott vagy?
A Kamome Akadémián pletykák keringenek az iskola Hét rejtélyéről, amelyek közül az egyik Hanako-san. Hanako-san azt mondják, hogy a régi iskolaépület harmadik emeleti lányfürdőjének harmadik bódéját foglalja el, és minden kívánságot teljesít, ha hívják. Nene Yashiro, egy okkult szerelmes középiskolás lány, aki romantikáról álmodik, bemerészkedik ebbe a kísértetjárta fürdőszobába... de a Hanako-san, akivel ott találkozik, semmi sem olyan, mint ahogy elképzelte! A Kamome Akadémia Hanako-sanja...fiú!